中國種質資源國家庫貯存的種子達33．3萬份，成為世界上最大的種質資源寶庫，保存了許多具有重要經濟和科研價值的珍稀植物的“血脈”，為它們解除了“絕后”之憂。
由科技部主持的國家科技攻關項目“主要農作物和林木種質資源評價與利用研究”的順利完成，使國家種質庫增加了34種作物2．2萬余份種子，加上以前入庫的數量，國家庫長期貯存種子數量達到33．3萬份。至此，國家庫保存種質資源數量處于世界第一。同時，國家資源圃保存種質數達到3．8萬份，國家擁有種質資源總數達到37萬份。這一數量僅次于美國貯存的55.5萬份種質資源，位居世界第二。
國家種質資源庫還收集、搶救了三峽、贛南、粵北等開發區的一批珍稀、瀕危、優異種質和近緣野生植物。三峽庫區瀕臨滅絕的八棱絲瓜、具重要開發價值的紫色爆裂玉米和白色蘇麻等一批珍稀古老種質，都安全地保存在了國家庫里。
中國國家種質資源庫保存的數量及其多樣性為作物育種和生產提供了雄厚的物質基礎，受到世界各國的關注。中國科研人員通過鑒定、篩選，已創新出一批優異種質，在育種上發揮重要作用。
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國家種質庫是全國作物種質資源長期保存與研究中心。該庫在美國洛克菲勒基金會和國際植物遺傳資源委員會的部
國家種質庫的總建筑面積為3200平方米，由試驗區、種子入庫前處理操作區、保存區三部分組成。保存區建有兩個長期貯藏冷庫，總面積為300平方米，其容量可保存種質40余萬份。種質貯藏條件為：溫度-18℃±1℃，相對濕度<50%。
國家種質庫保存對象是農作物及其近緣野生植物種質資源，這些資源是以種子作為種質的載體，其種子可耐低溫和耐干燥脫水。國家種質庫在接納到種子后，需對種子進行清選、生活力檢測、干燥脫水等入庫保存前處理，然后密封包裝存入-18℃冷庫。入庫保存種子的初始發芽率一般要求高于90%，種子含水量干燥脫水至5%～7%，大豆8%。根據科學家估算，在上述貯藏條件下，一般作物種子壽命可保存50年以上。至2001年底，國家種質庫貯存的種質數量已達到33萬余份，長期保存的種質數量處于世界第一，為我國作物育種和生產提供了雄厚的物質基礎。該進展---“我國建成世界上最大種質資源庫”被中國科學院院士和中國工程院院士評選為“2001年中國十大科技進展新聞”，排列第4位。
按植物分類學統計，庫存資源種類不僅豐富，隸屬 35科192屬712種，而且這些種質的80%是從國內收集的，不少屬于我國特有的，其中國內地方品種資源占60%，稀有、珍稀和野生近緣植物約占10%。這些資源是在不同生態條件下經過上千年的自然演變形成的，蘊藏著各種潛在可利用基因，是國家的寶貴財富，是人類繁衍生存的基礎。國家把這些資源收集起來作為戰略資源加于保存，以備子孫后代加以利用。隨著貯存數量、種類多樣性的增加，以及貯存時間的延長，國家庫貯存資源正在發揮其重要作用，并受到世界的高度重視。1998年以來，已有云南農科院、山西農科院、江蘇鹽都農科所、湖南水稻所、湖南原子能農業應用研究所、中國農業科學院煙草所，中國農業科學院作物所等十多個單位，從國家長期庫取出在原保種單位已絕種的種質材料，作為原種材料應用于育種項目及其國家重大科技項目的研究。以國家種質庫貯存資源為依托，開發其遺傳潛力的國家重大科學工程也已啟動。此外，每年有上千人次的中外學者及大中小學生來這里參觀學習，是植物遺傳資源多樣性保護的重要宣傳和教學基地。
