1994年5月3日世界首例轉基因水稻在安徽省合肥市問世。這是中國科學院合肥分院等離子體物理研究所科研人員，用本所在國際上首創的離子束介導法，與安徽省農科院聯合攻關多年育成的。經檢驗證明，其外源基因在后代中遺傳。這一重大突破為定向育種開拓了新路。
專家介紹，通過有目的的基因轉移，實現物種定向遺傳改良，是當今生命科學研究中熱門的高科技領域。中科院等離子體物理研究所是我國熱核聚變和相關等離子體物理研究的主力單位之一，這個所科研人員80年代初在國際上率先提出離子束生物育種方法，取得一系列成果，研究范圍擴展到糧、棉及微生物等很多方面。
轉基因水稻是這個研究所博士研究生在導師許智宏、余增亮、吳家道等精心指導下進行的研究項目。他們用低能離子束在種子上打孔，穿破種子外皮和細胞壁，再將選定的被轉移物帶有已知遺傳特性的基因片斷，用離子束整合到種子細胞的基因組中，從而使該種子具有被轉移物已有某些遺傳特性。他們育出的轉基因水稻，經分子水平檢測及多種方法檢測，證明外源基因確已存在被測水稻基因中，并且該性狀能夠進行遺傳。
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轉基因工程自20世紀70年代誕生以來，已經取得迅速的發展。據汪其懷（2000年）報導，在1
996～1999年全球共有12個國家種植轉基因農作物。美國是轉基因農作物種植面積最大的國家，中國居第4位，但種植面積僅占全球總面積的1%.目前，轉基因生物技術的研究，大多分布在抗蟲基因工程、抗病基因工程、抗逆基因工程、品質基因工程、品質改良基因工程、控制發育的基因工程等領域。如抗蟲基因工程將Bt基因導入棉花、玉米、水稻、煙草、馬鈴薯等作物，毒殺害蟲；或將膠蛋白酶抑制劑基因導入作物，干擾害蟲消化作用，而導致害蟲死亡。中國是繼美國之后育成轉基因抗蟲棉的第二個國家�，F在河北省與美國孟山都合作育成33B抗蟲棉（高抗棉鈴蟲、抗枯萎病、耐黃萎病）。由中國農科院生物中心、江蘇省農科院導入Bt基因，由安徽省種子公司，安徽省東至縣棉種場共同選育的抗蟲棉“國抗1號”在安徽省已通過審定。國際水稻所將抗蟲基因導入水稻，育成抗二化螟、縱卷葉螟的轉基因水稻。中國 農科院、中國農業大學、中國科學院、河南農科院等許多科研單位和高校將幾丁質酶和葡聚糖酶雙價基因導入小麥育成抗病轉基因小麥、轉基因煙草、轉基因水稻等等。英國愛丁堡大學將水母發光基因導入煙草、芹菜、馬鈴薯等作物，獲得發光作物，驅趕害蟲。目前在其它轉基因工程方面也取得了許多成果，在此不能一一例舉�？傊谧魑锓N類方面，大多集中在大豆、玉米、棉花、油菜、馬鈴薯、南瓜、木瓜、西葫蘆七大類作物。
在油菜方面利用轉基因工程培育雄性不育系及其恢復系的研究也取得了突破性的進展。比利時為了提高菜餅粗蛋白質的含量，將一種草控制的蛋白質基因轉移到油菜上來，選出高蛋白質含量的轉基因油菜品種。瑞典Svalow-Weibull等公司利用基因工程技術將外源基因導入甘藍型油菜，培育成抗除草劑油菜新品種；比利時PGS公司采用基因工程手段創造出新的油菜授粉系統；法國應用原生質體融合技術將蘿卜不育細胞質的恢復基因引入甘藍型油菜，充分利用蘿卜不育細胞質不育徹底的特性，實現了蘿卜不育細胞質的三系配套，對推動全球雜交油菜育種具有革命性的影響。據戴離安（2000年）報導，美國Galgene公司的研究人員將加利福尼亞月桂樹中的硫酸酶基因和可可植物中的�；D移酶基因轉入油菜，可獲得月桂酸含量高達70%的轉基因油菜，為制造肥皂、洗發香波、化妝品、去污劑、表面活性劑等工業提供原料，降低生產成本。美國孟山都公司，把抗草甘磷的基因轉入油菜，在加拿大已有70%以上的油菜面積使用這種抗除草劑的油菜品種。目前又有研究單位將利用從蘇云金桿菌中分離的毒蛋白基因（Bt）轉入油菜，獲得抗蟲油菜。又有研究單位將從豆類或西紅柿中克隆出的幾丁質酶基因轉入油菜中，培育出抗真菌病害的油菜。中國科學院遺傳所和微生物所，將蕪菁花菜病毒外殼基因轉化到甘藍型油菜中，得到抗病素的轉基因油菜植株。1994年，印度Eapen研究獲得轉基因花生，國內學者在花生基因工程技術也取得了突破性進展，但還有許多路要走，還要逐步完善和實用化。
