在昆明植物園，有珍稀瀕危物種杜鵑紅山茶、檸檬金花茶、崇左金花茶等。這株金花茶是1965年在廣西發現的，被譽為植物界的大熊貓。
在茶花界，一向有云南山茶甲天下之說。這是大理山茶，這是楚雄山茶，在昆明植物園的云南山茶區，有130多個云南的山茶品種，它們現在都在競相開花媲美。
昆明植物園的所有山茶園區占地80畝，除了云南山茶區，還有華東山茶區、精品山茶區等等。有華東山茶340多個品種，茶梅60個品種，金花茶20余種，總共有640個分類單位，品種之多堪稱世界之最，昆明植物園已經通過了《國際杰出茶花園》認證。2月18號這里將舉辦首屆中科院植物園名花展 ---昆明植物園山茶花展。在花展舉辦之前，昆明植物園特別舉行了熱愛自然，保護植物活動。園林專家們特別提醒來賞花的市民，一定要愛花護花，珍愛每一種植物。
